EpiScope® Methylated HeLa gDNA酶试剂盒Takara


EpiScope® Methylated HeLa gDNA
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Takara 3520 EpiScope® Methylated HeLa gDNA 15 μg ¥2,183 EpiScope® Methylated HeLa gDNA EpiScope® Methylated HeLa gDNA EpiScope® Methylated HeLa gDNA
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■ 制品内容
EpiScope® Methylated HeLa gDNA 15 μg
   
贮存溶液  
ETris-HCl (pH8.0) 10 mM
EDTA 1 mM
 
■ 制品说明
DNA甲基化分析是近年来倍受研究者关注的表观遗传学领域之一。据了解,在哺乳动物基因组DNA中的CpG序列上有一些胞嘧啶被甲基化。特别是基因启动子区域的CpG岛的甲基化是主要研究领域,其甲基化状态与基因表达调控有关。分析DNA甲基化的方法有多种,可使用Bisulfite sequence等方法。
EpiScope® Methylated HeLa gDNA是使用CpG methylase将人HeLa细胞来源的基因组DNA进行高度甲基化,在各种DNA甲基化分析中作为阳性对照使用。
 
■ 保存
-20℃。
 
■ 起源及制备
使用CpG methylase (M.Sss I) 对从人HeLa细胞中提取精制的基因组DNA进行甲基化,再进行PCI/CI抽提、乙醇沉淀精制。
 
■ 用途
作为以下所述的各种DNA甲基化分析的阳性对照使用。
·Bisulfite sequence
·Combined Bisulfite Restriction Analysis (COBRA)
·Methylated CpG Island Recovery Assay (MIRA) 等。
 
 

页面更新:2019-12-29 14:48:58

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠) 货 号 #E7400LNEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于所有测序平台/模块和酶

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#E7400L
24 次反应
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NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)- 含 RNA 纯化磁珠

产品特点:

· 高效去除人、小鼠、大鼠 RNA 中的 rRNA

· 可去除细胞质 rRNA(包括 5S rRNA、5.8S rRNA、18S rRNA、28S rRNA、人 ITS 和人 ETS)和线            粒体 rRNA(12S rRNA 和 16S rRNA)
· 起始量范围广:10 ng-1 μg
· 同时适用于低质量和高质量 RNA 样本
· 超快速工作流程:仅需 2 小时,手动操作时间少于 10 分钟
· 可提供 RNAClean 磁珠
 

概述:

 高丰度的核糖体 RNAs(rRNAs)占总 RNA 的 80-90%,进行二代测序和其它应用前需要在上游实验中将其去除。NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 优化了试剂、探针和操作手册,去除效果更卓越。基于 RNAse-H 的高效工作流程和紧密的探针间距,能高效地从低质量和高质量 RNA 中去除 rRNA,针对广泛的起始量范围亦同样有效。

产品描述:

 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)            货   号                  #E7400L

从不同起始量的人、小鼠、大鼠样品中,NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 均能高效富集目的 RNAs。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)从人、小鼠和大鼠通用参考总 RNA(1 µg、100 ng 和 10 ng)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。从每个文库中抽取(seqtk)1000 万个 Reads,并使用 Mirabait(6 个或更多,25-mers)鉴定去除文库中的 rRNA 残留,人 rRNA 探针取自 5S、5.8S、12S、16S、18S、28S、ETS/ITS;小鼠/大鼠 rRNA 探针取自 5S、5.8S、12S、16S、18S、28S。残留的 rRNA 水平是通过将匹配上的 Reads 数除以质控过滤后的总 Reads 数计算得出。数据代表 3 次重复的平均值。结果表明:从不同起始量的人、小鼠、大鼠样品中,NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 均能高效去除 rRNA。

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)            货   号                  #E7400L

使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2,不会影响目的转录本的丰度。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)从人、小鼠和大鼠通用参考总 RNA(1 µg)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒分别对去除后和未去除的 RNA 制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。从去除后的文库中抽取(seqtk)1000 万个 Reads,从未去除的文库中抽取 1 亿个 Reads。使用 Salmon 计算 GENCODE v27 转录本的丰度。图中显示了线性拟合的 Read 计数和 R2 值。结果表明:测试的所有物种去除 rRNA 后转录表达水平与未去除文库一致。

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)            货   号                  #E7400L

不同起始量情况下,样本文库之间都保持一致的转录表达相关性。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)从人、小鼠和大鼠通用参考总 RNA(1 µg)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。使用 Salmon 计算 GENCODE v27 转录本的丰度。图中显示了线性拟合的 Read 计数和 R2 值。结果表明:测试的所有起始量转录表达相关性保持一致。

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)            货   号                  #E7400L

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 在保证转录本丰度的同时,能有效地从降解的 FFPE 总 RNA 中去除 rRNA。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)(A、B、C)和 TruSeq® Stranded Total RNA Gold Kit(A)从成人正常肝组织 FFPE 总 RNA(RIN 2.3,100 ng 和 10 ng)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。从去除后的文库中抽取(seqtk)2000 万个 Reads,从未去除的文库中抽取 2 亿个 Reads。图(A)使用 Mirabait(6 个或更多,25-mers)鉴定去除文库中的 rRNA 残留,人 rRNA 探针取自 5S、5.8S、12S、16S、18S、28S、ETS/ITS。残留的 rRNA 水平是通过将匹配上的 Reads 数除以质控过滤后的总 Reads 数计算得出。数据代表 3 次重复的平均值,误差条表示标准差。(B)和(C)使用 Salmon 计算 GENCODE v27 转录本的丰度。图中显示了线性拟合的 Read 计数和 R2 值。结果表明:NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)能从 FFPE(降解的)样本中高效去除 rRNA,并可灵活应用于低起始量,且在不同起始量情况下,去除后的转录表达相关性也保持一致。

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)            货   号                  #E7400L

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 能从人类总 RNA 中同时去除成熟的 rRNA 和 rRNA 前体。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒(人/小鼠/大鼠)(NEB #E6310)和 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)(NEB #E7400)从人通用参考总 RNA(1 µg)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。从每个文库中抽取(seqtk)1000 万个 Reads,使用 Mirabait(6 个或更多,25-mers)鉴定去除文库中的 rRNA 残留,人 rRNA 探针取自 5S、5.8S、12S、16S、18S、28S、ETS/ITS。残留的 rRNA 水平是通过将匹配上的 Reads 数除以质控过滤后的总 Reads 数计算得出。数据代表 3 次重复的平均值。结果表明:NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 能高效去除 rRNA。
 
试剂盒包括:
NEBNext® DNase I
NEBNext® 耐热 RNase H
NEBNext® v2 rRNA 去除液
RNase H 反应缓冲液
DNase I 反应缓冲液
无核酸酶污染的水
NEBNext® 探针杂交缓冲液

 

 

 

McrBC酶试剂盒Takara


McrBC
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Takara 1234A McrBC 200 U ¥350 McrBC McrBC McrBC
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5’ …PumC(Nn)PumC…3’
*Pu: A or G, mC: 5-hydroxymethylcytosine, 5-methylcytosine, 4-methylcytosine, n=40-2,000
 
附带试剂
     10X McrBC Buffer 500 μl
     0.1% BSA 1 ml
     100 mM GTP(100 ×) 50 μl
 
■ 制品说明
McrBC是一种作用于含有甲基胞嘧啶DNA的特异性核酸内切酶,不作用于非甲基化DNA。它能够特异性地识别和切割包含两个(G/A)mC间距在40 bp-2000 bp的DNA序列。(G/A)mC中的甲基化胞嘧啶可以是5-羟甲基胞嘧啶, 5-甲基胞嘧啶或4-甲基胞嘧啶。
 
■ 起 源
大肠杆菌表达的重组体蛋白质。
 
■ 反应温度
37℃
 
■ 活性确认
在50 μl反应液中,37℃下反应1小时,将0.25 μg的含有单一McrBC酶切位点的线型pBR322 (pBR322-mu-BamH I-M Alu I) 完全分解,所需要的酶量定义为1个活性单位(U)。
 
■ 用途
DNA甲基化位点解析 (qAMP:应用Real Time PCR方法定量解析DNA甲基化位点) 。
富集非甲基化DNA (CHARM:Comprehensive high-throughput arrays for relative methylation, Genome Res. 2008 May;18(5):780-90. Epub 2008 Mar 3.)
 
 

页面更新:2021-04-19 11:20:56

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)- 含 RNA 纯化磁珠 货 号 #E7405LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于所有测序平台/模块和酶

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)- 含 RNA 纯化磁珠                              收藏

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NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)

 

产品特点:

·高效去除人、小鼠、大鼠 RNA 中的 rRNA

·可去除细胞质 rRNA(包括 5S rRNA、5.8S rRNA、18S rRNA、28S rRNA、人 ITS 和人 ETS)和线粒体 rRNA(12S rRNA 和 16S rRNA)
· 起始量范围广:10 ng-1 μg
· 同时适用于低质量和高质量 RNA 样本
· 超快速工作流程:仅需 2 小时,手动操作时间少于 10 分钟
· 可提供 RNAClean 磁珠
 

概述:

 高丰度的核糖体 RNAs(rRNAs)占总 RNA 的 80-90%,进行二代测序和其它应用前需要在上游实验中将其去除。NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 优化了试剂、探针和操作手册,去除效果更卓越。基于 RNAse-H 的高效工作流程和紧密的探针间距,能高效地从低质量和高质量 RNA 中去除 rRNA,针对广泛的起始量范围亦同样有效。

产品描述:

 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)- 含 RNA 纯化磁珠            货   号                  #E7405L

从不同起始量的人、小鼠、大鼠样品中,NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 均能高效富集目的 RNAs。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)从人、小鼠和大鼠通用参考总 RNA(1 µg、100 ng 和 10 ng)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。从每个文库中抽取(seqtk)1000 万个 Reads,并使用 Mirabait(6 个或更多,25-mers)鉴定去除文库中的 rRNA 残留,人 rRNA 探针取自 5S、5.8S、12S、16S、18S、28S、ETS/ITS;小鼠/大鼠 rRNA 探针取自 5S、5.8S、12S、16S、18S、28S。残留的 rRNA 水平是通过将匹配上的 Reads 数除以质控过滤后的总 Reads 数计算得出。数据代表 3 次重复的平均值。结果表明:从不同起始量的人、小鼠、大鼠样品中,NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 均能高效去除 rRNA。

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)- 含 RNA 纯化磁珠            货   号                  #E7405L

使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2,不会影响目的转录本的丰度。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)从人、小鼠和大鼠通用参考总 RNA(1 µg)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒分别对去除后和未去除的 RNA 制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。从去除后的文库中抽取(seqtk)1000 万个 Reads,从未去除的文库中抽取 1 亿个 Reads。使用 Salmon 计算 GENCODE v27 转录本的丰度。图中显示了线性拟合的 Read 计数和 R2 值。结果表明:测试的所有物种去除 rRNA 后转录表达水平与未去除文库一致。

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)- 含 RNA 纯化磁珠            货   号                  #E7405L

不同起始量情况下,样本文库之间都保持一致的转录表达相关性。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)从人、小鼠和大鼠通用参考总 RNA(1 µg)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。使用 Salmon 计算 GENCODE v27 转录本的丰度。图中显示了线性拟合的 Read 计数和 R2 值。结果表明:测试的所有起始量转录表达相关性保持一致。

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)- 含 RNA 纯化磁珠            货   号                  #E7405L

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 在保证转录本丰度的同时,能有效地从降解的 FFPE 总 RNA 中去除 rRNA。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)(A、B、C)和 TruSeq® Stranded Total RNA Gold Kit(A)从成人正常肝组织 FFPE 总 RNA(RIN 2.3,100 ng 和 10 ng)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。从去除后的文库中抽取(seqtk)2000 万个 Reads,从未去除的文库中抽取 2 亿个 Reads。图(A)使用 Mirabait(6 个或更多,25-mers)鉴定去除文库中的 rRNA 残留,人 rRNA 探针取自 5S、5.8S、12S、16S、18S、28S、ETS/ITS。残留的 rRNA 水平是通过将匹配上的 Reads 数除以质控过滤后的总 Reads 数计算得出。数据代表 3 次重复的平均值,误差条表示标准差。(B)和(C)使用 Salmon 计算 GENCODE v27 转录本的丰度。图中显示了线性拟合的 Read 计数和 R2 值。结果表明:NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)能从 FFPE(降解的)样本中高效去除 rRNA,并可灵活应用于低起始量,且在不同起始量情况下,去除后的转录表达相关性也保持一致。

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)- 含 RNA 纯化磁珠            货   号                  #E7405L

NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 能从人类总 RNA 中同时去除成熟的 rRNA 和 rRNA 前体。使用 NEBNext® rRNA 去除试剂盒(人/小鼠/大鼠)(NEB #E6310)和 NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2(人/小鼠/大鼠)(NEB #E7400)从人通用参考总 RNA(1 µg)中去除 rRNA。使用 NEBNext® Ultra™ II RNA 定向文库制备试剂盒制备文库,并进行 Illumina 双端测序(2 x 75 bp)。从每个文库中抽取(seqtk)1000 万个 Reads,使用 Mirabait(6 个或更多,25-mers)鉴定去除文库中的 rRNA 残留,人 rRNA 探针取自 5S、5.8S、12S、16S、18S、28S、ETS/ITS。残留的 rRNA 水平是通过将匹配上的 Reads 数除以质控过滤后的总 Reads 数计算得出。数据代表 3 次重复的平均值。结果表明:NEBNext® rRNA 去除试剂盒 v2 能高效去除 rRNA。
 
试剂盒包括:
NEBNext® DNase I
NEBNext® 耐热 RNase H
NEBNext® v2 rRNA 去除液
RNase H 反应缓冲液
DNase I 反应缓冲液
无核酸酶污染的水
NEBNext® 探针杂交缓冲液
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TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA)酶试剂盒Takara


TaKaRa EpiTaq HS (for bisulfite-treated DNA)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Takara R110Q TaKaRa EpiTaq HS (for bisulfite-treated DNA) 50 U ¥481 TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA) TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA) TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA)
Takara R110A TaKaRa EpiTaq HS (for bisulfite-treated DNA) 250 U ¥2,003 TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA) TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA) TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA)
Takara R110B (A × 4) TaKaRa EpiTaq HS (for bisulfite-treated DNA) 250 U × 4 ¥7,209 TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA) TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA) TaKaRa EpiTaq™ HS (for bisulfite-treated DNA)
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■ 制品内容 (Code No.: R110A)
TaKaRa EpiTaq HS (5 U/μl) 250 U
10 × EpiTaq PCR Buffer (Mg2+ free) 1 ml
dNTP Mixture (各2.5 mM) 1.2 ml
25 mM MgCl2 1.2 ml
 
 
■ 制品说明
TaKaRa EpiTaq HS (for bisulfite-treated DNA) 是用于亚硫酸氢盐修饰后含有尿嘧啶的模板DNA进行PCR扩增时所需的理想DNA聚合酶。亚硫酸氢盐修饰后的DNA有时会影响PCR反应性能,本制品中的镁离子及dNTP浓度经调整后可调节扩增效率和反应特异性,能够很好地扩增难扩增的目的片段。
本制品适用于Hot Start PCR,高温加热前,抗Taq单克隆抗体与Taq酶结合,抑制聚合酶的活性,从而抑制低温条件下由引物的非特异性退火或引物二聚体引起的非特异性扩增。抗体在PCR反应最初的DNA变性步骤已变性,因此无需特殊变性,在常规的PCR反应条件下即可使用。
 
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-20℃。
 
 
Technote:
Superior amplification of bisulfite-treated DNA for methylation studies
 

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NEBNext® Ultra™ II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒 货 号 #E7410LNEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

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 NEBNext® Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)

 NEBNext® Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶

NEBNext® Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶(含纯化磁珠)

产品特点

·起始量范围广:250 ng 至 1,000 ng 的起始 DNA 均可制备高质量文库,且无需扩增步骤

 ·更高的文库产量,获得更多有用信息
 ·提高文库均一性,进而提高测序质量
 ·不同类型的起始样本,均可制备 PCR-free 文库
 ·通过优化的 PCR-free 实验流程,减少手动操作时间,并可与自动化兼容
 ·配合使用 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)           (NEB #E7395)或其它具有3′ T 突出的适用于 Illumina 平台的接头
 ·也可提供含有样品纯化磁珠的 NEBNext Ultra II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)
 

产品概述

 没有偏差!基于简化可靠的 Ultra II 流程,适用于 Illumina® 测序平台的本试剂盒可为 DNA-seq 提供无需扩增的文库制备流程。即使 DNA 起始量低至 250 ng,也可获得高质量、高产量的文库,而无需担忧 PCR 偏差。


NEBNext Ultra II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒包含不同起始量、已打断的 DNA 文库制备所需的所有酶和缓冲液,以便在 Illumina 平台上进行二代测序,且不需要扩增步骤。快速、用户友好的流程仅需最少的手动操作时间,在无需 PCR 的情况下,就可获得优异的文库产量和 GC 覆盖度。

注意:如果您的起始 DNA 尚未打断,我们推荐您使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-Free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶,该试剂盒将 DNA 片段化、末端修复和加 dA 尾优化到同一管中,无需纯化或移液。
 
产品描述:
NEBNext® Ultra™ II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒            货   号                  #E7410L
 
使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒,能获得更高的文库产量。
A.以 1 µg NA19240 基因组 DNA(Coriell Institute)为起始样本,使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒和 Illumina TruSeq® PCR-free 文库制备试剂盒分别制备 PCR-free 文库,350 bp 插入片段作为筛选标准。
B.分别使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒和 Roche Sequencing Kapa HyperPrep 文库制备试剂盒,结合 Covaris 打断,制备 150 – 200 bp 插入片段的文库,不进行片段筛选。根据生产商推荐方法,NEBNext、Illumina 和 Kapa 试剂盒分别使用了 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)、IDT for Illumina(TruSeq DNA UD Indexes)和 Kapa Dual-Indexed Adaptors。
 
 NEBNext® Ultra™ II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒            货   号                  #E7410L
 
使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒,实现人类基因组均一覆盖。相较于 Illumina DNA PCR-free 文库制备试剂盒,NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒可实现更高的基因组覆盖度。根据生产商推荐方法,以 250 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本制备文库,使用 NovaSeq 6000 S4 v1.5 flow cell(PE 2 x 150 bp)测序。Reads 去接头(fastp 0.20.0)后比对至端粒到端粒 chm13 参考基因组(draft 1,bwa-mem 0.7.17),并标记重复(samblaster 0.1.24)。从每个 bam 中随机抽取 2.8 B Reads(sambamba view -s 0.6.8)。使用 mosdepth(v0.3.1,-F 772)评估过滤水平和初级覆盖度,并绘制常染色体或线粒体基因组图。图中标示出了预期覆盖度(num_reads*read length/genome size)。

Engrafted Cell Markers酶试剂盒Takara


Engrafted Cell Markers
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Cellartis Y40400 STEM101 50 μg ¥1,958 Engrafted Cell Markers Engrafted Cell Markers Engrafted Cell Markers
Cellartis Y40410 STEM121 50 μg ¥1,958 Engrafted Cell Markers Engrafted Cell Markers Engrafted Cell Markers
Cellartis Y40420 STEM123 50 μg ¥1,958 Engrafted Cell Markers Engrafted Cell Markers Engrafted Cell Markers
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监控人类细胞移植用途的抗体
(Antibodies for Detecting Human Cells Transplanted into Mice and Rats)
STEM101、STEM121、STEM123是三种小鼠来源的单克隆抗体,用于人类细胞向小鼠和大鼠移植实验中,监控细胞移植、转移、分化。
 
■ 产品特点
· STEM101 reacts specifically with the nuclear human Ku80 protein; the antibody does not cross-react with mouse or rat Ku80 in brain tissue or cell extracts
Note: STEM101 (Y40400) is not suitable for immunohistochemically staining on paraffin embedded tissue sections. We recommend using fresh frozen tissue with this antibody.
· STEM121 reacts with a human cytoplasmic protein expressed in brain, liver, pancreas, and CNS cells the antibody does not cross-react with brain tissue or cell extracts from mouse, rat, or cynomologous monkey
· STEM123 reacts specifically with human GFAP, a marker of astroglial cells; the antibody does not cross-react with brain tissue or cell extracts from mouse or rat
 
■ 产品应用
· Localization, quantification, and/or characterization of engrafted cells of human origin by immunohistochemistry and immunofluorescence
 
 
 
■ 产品详情请点击:Engrafted Cell Markers
 
Engrafted Cell Markers
STEM101 detects nuclei of transplanted human neural stem cells in the olfactory bulb of a mouse brain.
 
Engrafted Cell Markers
STEM121 detects migration and differentiation of transplanted human neural stem cells in the hippocampus of a mouse brain.
 
Engrafted Cell Markers
STEM123 detects human GFAP+ astrocytes differentiated from human neural stem cells after transplantation into a mouse brain.
 
参考文献:
1. Cummings BJ, et al. (2005) Human neural stem cells differentiate and promote locomotor recovery in spinal cord-injured mice. PNAS 102: 14069-14074.
2. Guzman R, et al. (2007) Long-term monitoring of transplanted human neural stem cells in developmental and pathological contexts with MRI. PNAS 104: 10211-10216.
3. Tamaki SJ, et al. (2009) Neuroprotection of Host Cells by Human Central Nervous System Stem Cells in a Mouse Model of Infantile Neuronal Ceroid Lipofuscinosis. Cell Stem Cell 5:310-319.
4. Salazar DL, et al. (2010) Human Neural Stem Cells Differentiate and Promote Locomotor Recovery in an Early Chronic Spinal Cord Injury NOD-scid Mouse Model. PLoS ONE 5: e12272.
5. Kelly S, et al. Transplanted human fetal neural stem cells survive, migrate, and differentiate in ischemic rat cerebral cortex. PNAS (2004) 101:11839 11844.
6. Cummings BJ, et al. Human neural stem cells differentiate and promote locomotor recovery in spinal cord-injured mice. PNAS (2005) 102: 14069-14074.
7. Tamaki SJ, et al. Neuroprotection of Host Cells by Human Central Nervous System Stem Cells in a Mouse Model of Infantile Neuronal Ceroid Lipofuscinosis. Cell Stem Cell (2009) 5:310-319.
8. Kallur T, et al. Human Fetal Cortical and Striatal Neural Stem Cells Generate Region-Specific Neurons In Vitro and Differentiate Extensively to Neurons After Intrastriatal Transplantation in Neonatal Rats. J Neurosci Res. (2006) 84:1630-1644.
9. Salazar DL, et al. Human Neural Stem Cells Differentiate and Promote Locomotor Recovery in an Early Chronic Spinal Cord Injury NOD-scid Mouse Model. PLoS ONE (2010) 5: e12272.
10. Tamaki SJ, et al. (2009) Neuroprotection of Host Cells by Human Central Nervous System Stem Cells in a Mouse Model of Infantile Neuronal Ceroid Lipofuscinosis. Cell Stem Cell 5:310-319.
11. Salazar DL, et al. (2010) Human Neural Stem Cells Differentiate and Promote Locomotor Recovery in an Early Chronic Spinal Cord Injury NOD-scid Mouse Model. PLoS ONE 5:e12272.
12. Cummings BJ, et al. (2005) Human neural stem cells differentiate and promote locomotor recovery in spinal cord-injured mice. PNAS 102: 14069-14074.
 

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NEBNext® Ultra™ II DNA PCR-free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠) 货 号 #E7415LNEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

NEBNext® Ultra™ II DNA PCR-free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)                              收藏

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相关产品

NEBNext® Ultra II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒

NEBNext® Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶

NEBNext® Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶(含纯化磁珠)

产品特点

·起始量范围广:250 ng 至 1,000 ng 的起始 DNA 均可制备高质量文库,且无需扩增步骤
·更高的文库产量,获得更多有用信息
·提高文库均一性,进而提高测序质量
·不同类型的起始样本,均可制备 PCR-free 文库
·通过优化的 PCR-free 实验流程,减少手动操作时间,并可与自动化兼容
·配合使用 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)(NEB #E7395)或其它具有3 T 突出的适用于 Illumina 平台的接头
·试剂盒提供 SPRIselect® 磁珠,可灵活方便地进行片段筛选和纯化
·也可提供不含样品纯化磁珠的 NEBNext Ultra II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒
 

产品描述

 没有偏差!基于简化可靠的 Ultra II 流程,适用于 Illumina® 测序平台的本试剂盒可为 DNA-seq 提供无需扩增的文库制备流程。即使 DNA 起始量低至 250 ng,也可获得高质量、高产量的文库,而无需担忧 PCR 偏差。

 
NEBNext Ultra II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒包含不同起始量、已打断的 DNA 文库制备所需的所有酶和缓冲液,以便在 Illumina 平台上进行二代测序,且不需要扩增步骤。快速、用户友好的流程仅需最少的手动操作时间,在无需 PCR 的情况下,就可获得优异的文库产量和 GC 覆盖度。
 
为方便起见,该试剂盒还提供 NEBNext 样品纯化磁珠(Beckman Coulter 的 SPRIselect 磁珠),可用于片段筛选和酶反应纯化步骤。
 
注意:如果您的起始 DNA 尚未打断,我们推荐您使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-Free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶,该试剂盒将 DNA 片段化、末端修复和加 dA 尾优化到同一管中,无需纯化或移液。
 
产品描述:
 
NEBNext® Ultra™ II DNA PCR-free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)            货   号                  #E7415L
 
使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒,能获得更高的文库产量。
A.以 1 µg NA19240 基因组 DNA(Coriell Institute)为起始样本,使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒和 Illumina TruSeq® PCR-free 文库制备试剂盒分别制备 PCR-free 文库,350 bp 插入片段作为筛选标准。
B.分别使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒和 Roche Sequencing Kapa HyperPrep 文库制备试剂盒,结合 Covaris 打断,制备 150 – 200 bp 插入片段的文库,不进行片段筛选。根据生产商推荐方法,NEBNext、Illumina 和 Kapa 试剂盒分别使用了 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)、IDT for Illumina(TruSeq DNA UD Indexes)和 Kapa Dual-Indexed Adaptors。
NEBNext® Ultra™ II DNA PCR-free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)            货   号                  #E7415L
使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒,实现人类基因组均一覆盖。相较于 Illumina DNA PCR-free 文库制备试剂盒,NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒可实现更高的基因组覆盖度。根据生产商推荐方法,以 250 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本制备文库,使用 NovaSeq 6000 S4 v1.5 flow cell(PE 2 x 150 bp)测序。Reads 去接头(fastp 0.20.0)后比对至端粒到端粒 chm13 参考基因组(draft 1,bwa-mem 0.7.17),并标记重复(samblaster 0.1.24)。从每个 bam 中随机抽取 2.8 B Reads(sambamba view -s 0.6.8)。使用 mosdepth(v0.3.1,-F 772)评估过滤水平和初级覆盖度,并绘制常染色体或线粒体基因组图。图中标示出了预期覆盖度(num_reads*read length/genome size)。
 

Human Stem Cell Culture System (DEF-CS, all-in-one format)酶试剂盒Takara


Human Stem Cell Culture System (DEF-CS, all-in-one format)
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Cellartis Y30010 Cellartis® DEF-CS 500 Culture System 1 Kit ¥5,979 Human Stem Cell Culture System (DEF-CS, all-in-one format) Human Stem Cell Culture System (DEF-CS, all-in-one format) Human Stem Cell Culture System (DEF-CS, all-in-one format)
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Human iPS和Human ES增殖用培养基
(DEF-CS Culture System, all-in-one format)
作为一款高端创新型的产品,Cellartis DEF-CS培养系统使得单细胞干细胞操作成为常规的操作。该产品是专门针对人类诱导干细胞(hiPS)和人类胚胎干细胞(hES)研发的高效率增殖用培养基产品体系。该产品系统为all-in-one型,包括了所有组分,客户不需要另外求购组分。该产品是成分确定的培养基产品,而且不需要饲养层。DEF-CS既可以实现单细胞培养,也可以用于传统的iPS培养模式以及大规模干细胞增殖。在使用DEF-CS培养基增殖干细胞时,几乎没有背景分化的问题,这使得细胞筛选不再必需。作为一款创新产品,利用DEF-CS培养干细胞时,可以使用酶消化法(enzymatic passaging)实现需要单细胞操作,这一特点十分有利于高通量细胞鉴别筛选(high-throughput screening)、转染(transfection)、框架接种(scaffold seeding)等。
 
■ 产品特点
· Feeder-free and chemically defined culture system for efficient expansion of human iPS cells
· Ideal system for culturing iPS cells; cells maintain pluripotency and long-term potential for self-renewal and differentiation
· Complete kit includes 500 ml basal medium, additives, and coating compound
· Robust system provides high reproducibility and stable growth
· Maintains cells in an undifferentiated state with virtually no background differentiation
 
■ 产品应用
· Scale-up and mass production of human iPS cells
· Single-cell culture of human iPS cells
· Transfection and reprogramming
· High-throughput screening
· Tissue engineering (seeding cells on a scaffold)
 
■ 产品详情请点击:Human Stem Cell Culture System (DEF-CS, all-in-one format)
 
Human Stem Cell Culture System (DEF-CS, all-in-one format)
Robust growth of human induced pluripotent stem (iPS) cells in the Cellartis DEF-CS Culture System. The number of iPS cells was quantified after being cultured for three weeks using either the Cellartis DEF-CS Culture System, a reference feeder system, or four other stem cell culture systems.
 
参考文献:
1. Sivertsson, Louise, et al. "Hepatic differentiation and maturation of human embryonic stem cells cultured in a perfused three-dimensional bioreactor." Stem cells and development 22.4 (2012): 581-594.
2. Hanson, Charles, et al. "Transplantation of human embryonic stem cells onto a partially wounded human cornea in vitro." Acta ophthalmologica 91.2 (2013): 127-130.
3. Norrman, Karin, et al. "Distinct gene expression signatures in human embryonic stem cells differentiated towards definitive endoderm at single-cell level." Methods 59.1 (2013): 59-70.
4. Ulvestad, Maria, et al. "Drug metabolizing enzyme and transporter protein profiles of hepatocytes derived from human embryonic and induced pluripotent stem cells." Biochemical pharmacology 86.5 (2013): 691-702.
5. Ramirez JM, et al. Side scatter intensity is highly heterogeneous in undifferentiated pluripotent stem cells and predicts clonogenic self-renewal. Stem Cells Dev.2013 Jun 15;22(12):1851-1860.
6. Borestrom, Cecilia, et al. “Footprint-free human induced pluripotent stem cells from articular cartilage with redifferentiation capacity: A first step toward a clinical-grade cell source.” Stem Cells Trans. Med. (2014) 3, 433-447.
7. Kia, Richard, et al. "MicroRNA-122: a novel hepatocyte-enriched in vitro marker of drug-induced cellular toxicity." Toxicological Sciences (2014): kfu269.
8. Valton, Julien, et al. "Efficient strategies for TALEN-mediated genome editing in mammalian cell lines."  Methods 69.2 (2014): 151-170.
9. Zandén, Carl, et al. "Stem cell responses to plasma surface modified electrospun polyurethane scaffolds." Nanomedicine: Nanotechnology, Biology and Medicine 10.5 (2014): 949-958.
10. Asplund, Annika, et al. “One Standardized Differentiation Procedure Robustly Generates Homogenous Hepatocyte Cultures Displaying? Metabolic Diversity from a Large Panel of Human Pluripotent Stem Cells” Stem Cell Rev and Rep (2015)
 
 
 
 

页面更新:2020-02-14 15:52:16

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA) 货 号 #E7416LNEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)                              收藏

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相关产品:

 NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)

产品特点:

 

·  高效稳定的连接效率

·  可支持更高通量

· 专为 RNA 文库优化

·  更准确地测定转录本丰度

概述:

 用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物是 NEBNext® 文库制备系列产品的重要组成部分,有多种不同的产品可用于 NEBNext® 产品或其它标准的 Illumina® 平台兼容的文库制备流程。该产品(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNANEB #7416)为 RNA 测序流程设计和优化。这些独特的双端检索引物接头还分别包含一段唯一的分子标签序列(UMI),包含一个独特的分子条形码(UMI)序列,以便更准确地分析转录组。通用引物也包含在内。

可提供适用于 DNA 测序的 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头(NEB #E7395),也可提供单端、双端和 Unique 双端引物以及优化的接头。

产品描述:

 NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)            货   号                  #E7416L

NEBNext® Unique 双端 UMI 接头具有同样有效的连接和随后扩增。

A:以通用人参考 RNAAgilent 740000)为起始样本,使用 NEBNext® Poly(A) mRNA 磁性分离模块(NEB #E7490)富集后,使用 NEBNext® Ultra II RNA 定向文库制备试剂盒(NEB #E7760)制备 96个文库。使用 Agilent Tapestation 4200 评估建库产量,通过将单个文库产量除以 96 个所有文库的平均产量对文库进行标准化。所有 96 Unique 双端 UMI 接头的一致性和连接效率都很高。每个条形图代表至少 2 个技术重复的平均值。

BNEBNext® Unique 双端 UMI 接头具有均一的聚类效率。文库使用 Illumina NextSeq® 500PE70)测序。每个文库预计占测序 reads 总数的1.04%通过将实际的 reads 数除以预期的 reads 数对文库产量进行标准化。96 Unique 双端 UMI 接头均未出现偏差

 

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)            货   号                  #E7416L

相较于其它 UMI 接头竞品,NEBNext Unique 双端 UMI 接头性能更优越。

以通用人参考 RNA 为起始样本,使用 NEBNext® Poly(A) mRNA 磁性分离模块(NEB #E7490)富集后,使用 NEBNext® Ultra II RNA 定向文库制备试剂盒(NEB #E7760)制备文库。

 

A:以 10 ng100 ng 1,000 ng 的总 RNA 为起始样本,图中显示了三个重复的平均文库产量。使用 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头或 IDT xGen 双端接头进行接头连接。使用 Agilent Tapestation 4200 评估最终建库产量
B
:文库使用 Illumina NextSeq® 500PE70)测序。Reads 降采样(seqtk500 万,并使用 HISAT 2.1 比对至 GRCh38 参考基因组。使用 fgbioAnnotateBamWithUmis)添加 UMI 信息,并使用 MarkDuplicatesPicard 2.18.2.1)标记含有 UMI reads 和检测重复率。NEBNext® Unique 双端 UMI 接头产生的文库产生的重复更少。

实验流程:

 NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)            货   号                  #E7416L

iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System酶试剂盒Takara


iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Cellartis Y30055 Cellartis® iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System 1 Kit ¥13,846 iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System
Cellartis Y30051 Cellartis® Hepatocyte Maintenance Medium 100 ml ¥2,198 iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System
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iPS向肝脏细胞定向分化操作系统
(Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System)
以肝脏细胞为模型的实验越来越受到重视,在肝脏病变机理研究、药物代谢研究、药物毒理评估等方面有广阔的应用前景。然而,以个体原代肝细胞为材料来源会产生如取材困难、材料批间差大、无法长期稳定供应等一系列难以克服的问题。因此,通过iPS批量转化生产肝细胞的方法就显示出特别的优势。Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System可以稳定地、规模化地实现iPS向hepatocyte的诱导转化生产,而且诱导转化出的肝细胞能够稳定表达药物代谢相关酶系统和药物转运系统。
Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System是一套Do-It-Yourself系统,客户既可以对某个特殊病人来源的iPS实现转化,也可以利用cellartis供应的iPS进行标准化操作。使用本产品的过程起始于诱导人iPS转化成为确定性内胚层(Definitive Endoderm (DE))细胞,然后诱导转化DE至肝细胞。本产品是All-In-One型产品,实验所需的培养基、基质(coating)等包括在内。应用本产品转化约3 × 106 hiPS cells,可以获得约5 × 106 肝细胞(大约50 cm2面积的单层贴壁细胞)。
利用Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System转化得到的肝细胞除了清晰表现出肝细胞的必备特征外(如肝细胞特异性标志物、CYP系列酶等),还保留了原始细胞供体者的遗传基因背景。另外,相比较从组织切除获得的原代肝脏细胞(通常需要低温保存),通过本产品系统转化获得的肝细胞在更长的时间跨度上保持着生理功能的稳定性。这一点对于毒理学评估和病毒感染评估具有显著的意义。为长时间维持培养hiPS转化而来的肝细胞,我们推荐Cellartis Hepatocyte Maintenance Medium (Cat. No. Y30051)。
 
关于Cellartis 卓越的iPS Cell to Hepatocyte Differentiation技术的专项说明,请点击:
详情
 
■ 产品特点
· Highly reproducible, robust system—the exact same protocol has been shown to work across 25 different iPS cell lines, so no need to optimize for your lines.
· Ideal for drug metabolism and safety studies—consistently generate panels of >90% pure, functional, hiPS cell-derived hepatocytes with diverse genetic backgrounds.
· Customized starting materials—start with any disease-relevant iPS cell lines and create accurate liver disease models.
· Ready for personalized medicine—make patient-specific, disease-specific cells for therapeutic applications.
· Extended experimental window—hepatocytes can be used for a minimum of 11 days for functional tests.
 
■ 产品成分
· Cellartis DEF-CS 100 Culture System (Y30020, not sold separately)
· Cellartis Definitive Endoderm Differentiation Kit (Y30030, not sold separately)
· Cellartis Hepatocyte Differentiation Kit (Y30050)
 
■ 产品详情请点击:iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System
 
iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System
Immunocytochemistry analysis of hepatocyte differentiation. hiPS cells were differentiated into functional hepatocytes using the Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System. Hepatocytes were immunostained to detect early hepatic markers HNF4α (red, nuclear) and CK18 (green) on days 14 and 21. As the hepatocytes matured, expression of liver-specific markers CYP3A (red, cytoplasmic) and Albumin (green) increased as seen on day 28, as expected. Cell nuclei were stained with DAPI (blue).
 
参考文献:
Asplund, Annika, et al.One Standardized Differentiation Procedure Robustly Generates Homogenous Hepatocyte Cultures Displaying? Metabolic Diversity from a Large Panel of Human Pluripotent Stem Cells. Stem Cell Rev and Rep (2015).
 
用户分享:
◆ 东海大学医学部-纸谷聪英教授
   利用人iPS细胞体外构建多囊性肝病(Polycystic liver disease)模型
 
iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System
纸谷聪英教授使用Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System(Y30055)构建肝脏疾病模型的研究成果已刊登在Stem Cell Research。
【论文】
Akihide, K., Hiromi, C., Kinuyo, I., Emi, A., Kota, T., & Tatehiro, K., et al. (2018). An in vitro model of polycystic liver disease using genome-edited human inducible pluripotent stem cells. Stem Cell Research, 32, 17-24.
 
实验数据
 
iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System
 
图:使用 Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System(Y30055)获得的人iPSC来源肝前体细胞(iPS-HPCs)诱导分化为胆管状Cyst结构。
(引用自文献Akihide Kamiya et al., Stem Cell Research, 2018)
 
访谈时间:
1. 开始使用Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System(Y30055)的契机是什么?
很多研究组已经报道了多种从人iPS细胞诱导分化形成肝脏细胞的方法,我们研究组也在做相关工作。由于细胞分化不稳定,我担心使用饲养层细胞培养人iPS细胞会对肝脏分化产生影响,因此决定尝试使用Cellartis iPS细胞无饲养层培养系统Cellartis DEF-CS™ 500 Culture System(Y30010)和肝脏分化系统Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System(Y30055)。
 
2.实际使用后感觉如何?
与之前使用的饲养层培养方法相比,Y30010能更简便高效的进行培养;使用Y30055进行的肝脏分化非常稳定,进一步提升了实验效率。
 
3. 对暂未使用该制品的用户有什么寄语?
人iPS细胞向肝脏细胞分化过程中,细胞密度对分化效率有很大影响,进而影响实验结果。我认为Cellartis系统的优点主要在于各个实验阶段偏差小,结果稳定,适合追求实验效率的人。
 
 
◆ 东京医科齿科大学-柿沼晴教授
   先天性肝纤维化模型的开发和病理阐明的研究
 
iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System
柿沼晴教授使用Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System(Y30055)构建肝脏疾病模型的研究成果已刊登在Journal of Hepatology。
 
【论文】
Tsunoda, T., Kakinuma, S., Miyoshi, M., Kamiya, A., Kaneko, S., & Sato, A., et al. (2019). Loss of fibrocystin promotes interleukin-8-dependent proliferation and ctgf production of biliary epithelium. Journal of Hepatology.
 
访谈时间:
1.开始使用Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System(Y30055)的契机是什么?
一起进行研究的老师使用后能够进行稳定的培养,我们研究室也正好想利用无饲养层培养系统,所以开始使用了Cellartis DEF-CS™ 500 Culture System(Y30010)和肝脏分化系统Cellartis iPS Cell to Hepatocyte Differentiation System(Y30055)。
 
2.实际使用后感觉如何?
Y30010无饲养层培养系统使用比较简便,同时能够稳定的培养人iPS细胞。这次实验中,利用Y30055分化至肝前体细胞(iPS-HPCs),进一步诱导分化成了胆管细胞,我认为诱导分化的再现性好。不仅分化至成熟肝细胞谱系,同时相比于以往报道的方法,再现性更稳定。
 
3. 对暂未使用该制品的用户有什么寄语?
在人iPS细胞的培养和分化至肝细胞谱系的诱导中,即使是对人iPS细胞使用经验尚浅的实验者,也能够进行培养并得到稳定的再现。
 
 

页面更新:2020-01-16 16:00:18

Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK

【简单介绍】

Whatman给实验者提供了多种材质的滤膜,先进的技术规范使得今天很多的应用都更愿意选择Whatman
产品。滤膜的孔径精确、韧性好,保证了再现性和一致性。Whatman滤膜孔径范围很广,从0.2µm-12µm,并有很多选择的膜过滤容器。
无菌和消毒包装可用于特殊应用中,也有着色网格类型可供选择。

【简单介绍】

Whatman给实验者提供了多种材质的滤膜,先进的技术规范使得今天很多的应用都更愿意选择Whatman
产品。滤膜的孔径精确、韧性好,保证了再现性和一致性。Whatman滤膜孔径范围很广,从0.2µm-12µm,并有很多选择的膜过滤容器。
无菌和消毒包装可用于特殊应用中,也有着色网格类型可供选择。

【详细说明】

原装进口英国Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK

英国Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK

产品介绍:

Whatman给实验者提供了多种材质的滤膜,先进的技术规范使得今天很多的应用都更愿意选择Whatman
产品。滤膜的孔径精确、韧性好,保证了再现性和一致性。Whatman滤膜孔径范围很广,从0.2μm-12μm,并有很多选择的膜过滤容器。
无菌和消毒包装可用于特殊应用中,也有着色网格类型可供选择。

产品特点:

Nuclepore聚碳酸径迹蚀刻膜由高质量的聚碳酸薄膜制成,具有孔径精确、流速快等特点,并且有着极好的耐化学性和耐热性,这类膜表面光滑而平整,对提取物几乎没有吸附。这种膜还有黑色膜,背景反差大,用于荧光和其它显微镜法。

Track-Etched Polycarbonate and Polyester Membranes

径迹蚀刻聚碳酸酯膜和聚脂膜

Nuclepore Track-Etched Membranes聚碳酸酯膜

Nuclepore聚碳酸酯径迹蚀刻膜是由高品质的聚碳酸酯薄膜制成,具有孔径精确、流速快等特点。并且有着极好的耐化学性和耐热性。这类膜表面光滑而平整,对提取物几乎没有吸附。

特性

不吸附蛋白和提取物,对样品无污染

良好的耐化学性和热稳定性,适用于大多数样品

低灰分、低皮重

膜表面光滑而平整,便于对截留物粒子进行观察

可提供黑色膜,用于荧光和其他纤维镜法,背景反差大

应用

荧光显微镜、生物分析、环境分析、寄生生物学、细胞培养、空气分析、EPA检验、

水体微生物学、燃烧检测。

技术参数-Nuclepore聚碳酸酯膜

产品名

聚碳酸酯

厚度

6-11μm

爆裂强度

>10 psi

净重

0.6-1mg/ cm2

原料比重

1.20g/ cm2

热封范围

230-275

最高可耐高温

140

易燃性

Slow burn

灰度

0.92μg/ cm2

孔率

<15%

计算孔径

0.05-12.0μm

计算孔密度

10*5-6×10*8pore/ cm2

表面质地

平滑

透明度

半透明

折射率

1.584-1.625(双折射)

疏水

纤维释放

高温蒸汽灭菌

121

英国Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK
英国Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK
英国Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK
英国Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK
英国Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK
英国Whatman800319Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 19MM 1.0um 100/PK

上海金畔生物科技有限公司

文章号19706094-19706094

NEBNext RNA 定向文库制备试剂盒 货 号 #E7420LNEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

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产品特点

  –  Accurate retention of transcript strand of origin information

  –  Utilizes dUTP-based methodology

  –  Low input amounts (as low as 10ng purified mRNA or ribosomal-depleted RNA, or 100ng Total RNA)

  –  Fast workflow (4.5 – 5 hours), with minimal hands-on time

  –  Robust, reliable performance

  –  Ultra high fidelity amplification with minimized GC bias

概述

The NEBNext® Ultra™ Directional RNA Library Prep Kit for Illumina® contains reagents for preparation of strand-specific RNA libraries for Illumina sequencing. Please note that adaptors, primers, rRNA depletion

reagents and poly(A) mRNA isolation reagents are not included in the kit and are available separately.


Ultra Directional RNA Library Preparation for Illumina

NEBNext RNA 定向文库制备试剂盒            货   号                  #E7420L

 

NEBNext RNA 文库制备试剂 — 订购信息

NEBNext RNA 定向文库制备试剂盒            货   号                  #E7420L

适用于所有平台的试剂

NEBNext RNA 定向文库制备试剂盒            货   号                  #E7420L
 
 

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Human Stem Cell Derived Hepatocytes酶试剂盒Takara


Human Stem Cell Derived Hepatocytes
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Cellartis Y10133 Cellartis® Enhanced hiPS-HEP v2 (from ChiPSC12) Kit 1 kit ¥21,173 Human Stem Cell Derived Hepatocytes Human Stem Cell Derived Hepatocytes Human Stem Cell Derived Hepatocytes
Cellartis Y10134 Cellartis® Enhanced hiPS-HEP v2 (from ChiPSC18) Kit 1 kit ¥21,173 Human Stem Cell Derived Hepatocytes Human Stem Cell Derived Hepatocytes Human Stem Cell Derived Hepatocytes
Cellartis Y10135 Cellartis® Enhanced hiPS-HEP v2 (from ChiPSC22) Kit 1 kit ¥21,173 Human Stem Cell Derived Hepatocytes Human Stem Cell Derived Hepatocytes Human Stem Cell Derived Hepatocytes
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无标题文档

人iPS干细胞分化来的肝细胞
Cellartis enhanced hiPS-HEP v2 kits 提供了可持续供应的、成熟的人诱导多能干细胞(hiPS)来源的肝脏细胞。在超过14天的检测窗口期,hiPS-HEP细胞拥有功能性的药物代谢机制,使其成为体外药物研发、药物代谢、和相关毒性研究的理想选择;具备成熟、稳健的代谢特征,支持其作为代谢疾病模型。方便使用的试剂盒包括完全的培养基和组份,用于长期检测。与其他肝脏细胞模型相比,培养的Cellartis hiPS-HEP细胞存活时间更长,进而拥有更长的检测窗口用于慢性-毒性实验和作为代谢疾病模型研究。
 
■ 产品特点
· Complete kit for thawing, plating, and culturing the provided cells
· Highly homogeneous population with consistent performance between batches and over time
· Cells are functional and stable for a 14-day assay window
· Cells show long-term, stable CYP450 activities
· Cells express key hepatocyte proteins, including α1AT, Alb, CK18, HNF4α, and E-cadherin
· Cells secrete physiologically relevant levels of albumin and urea
· Cells demonstrate functional insulin and glucose regulation
· Cells show phase I and II enzyme activities
· Cells demonstrate LDL uptake
 
■ 产品组成
· 1 vial of ~1.2 × 107 cells
· Hepatocyte thawing medium
· Hepatocyte coating
· Hepatocyte plating medium
· Hepatocyte washing medium
· Hepatocyte long-term maintenance medium
 
■ 产品应用
· Toxicity testing, including chronic toxicity assays
· Drug discovery and development
· Metabolic studies
· Metabolic disease modeling
 
■ 产品详情请点击:Human Stem Cell Derived Hepatocytes
 
Human Stem Cell Derived Hepatocytes
 
Cellartis 人iPS细胞来源的肝脏细胞可以作为长期的、可靠的肝脏疾病模型。
Cellartis human induced pluripotent stem (iPS) cell-derived hepatocytes are a long-lasting, reliable liver disease model. Ideal for long-term studies, these mature, functional, pure hepatocytes allow you to generate consistent results with low batch-to-batch variability. Cellartis iPSC-derived hepatocytes can be used for extended culture significantly longer than human primary hepatocytes—allowing you to get more data from your chronic toxicity studies.
 
Human Stem Cell Derived Hepatocytes
 
Cellartis enhanced hiPS-HEP cells可以稳定表达CYP450 活性超过21天。
CYP450 activity is stable in enhanced hiPS-HEP cells over 21 days. LC/MS was used to analyze CYP450 activity in cultured enhanced hiPS-HEP cells previously derived from the hiPS cell lines ChiPSC12, ChiPSC18, and ChiPSC22 (abbreviated as C12, C18, and C22). CYP3A (Panel A), CYP2C9 (Panel B), CYP1A (Panel C), and CYP2C19 (Panel D) activities in enhanced hiPS-HEP cells are stable over an extended culture time. Cryopreserved human primary hepatocytes (hphep), which are functional in culture for a significantly shorter time than enhanced hiPS-HEP cells, were thawed and cultured for 20 hours, and their data are shown as the black bar in each panel.
 
Human Stem Cell Derived Hepatocytes
 
Cellartis enhanced hiPS-HEP细胞在20天的培养中表达白蛋白(Albumin)。
Albumin is present in enhanced hiPS-HEP cells through 20 days in culture. Panel A. Representative images of enhanced hiPS-HEP cells from human iPS cell line ChiPSC18 (C18) taken 12 days after thawing (right), compared to cryopreserved human primary hepatocytes (hphep) taken 24 hr after thawing (left). Cells were stained for albumin and DAPI. Panel B. Albumin secretion as measured by ELISA; n=2 for enhanced hiPS-HEP cells, with the exception of C18 at 20 days (n=1), and n=3 donors for hphep.
 
(以上图片均来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
参考文献:
1. Heins et al. Stem Cells 2004; 22: 367-376.United States National Stem Cell Bank; http://www.nationalstemcellbank.org.
2. Mantel N et al. Potential markers of attenuation of YF virus after infection of stem cell-derived human hepatocytes with wild-type Asibi or live-attenuated YF17D virus.Supplement to The American Journal of tropical Medicine and Hygiene, Volume 83, November 2010, Number 5, abstract 12.
3. Yildirimman R et al. Human embryonic stem cell derived hepatocyte-like cells as a tool for in vitro hazard assessment of chemical carcinogenicity. Toxicol. Sci. 2011 Dec; 124(2): 278-90.
4. Ulvestad M et al. Drug metabolizing enzyme and transporter protein profi les of hepatocytes derived from human embryonic and induced pluripotent stem cells. Biochem Pharmacol. 2013 Sep 1; 86(5):691-702.
 
 

页面更新:2019-12-29 13:16:24

NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶 货 号 #E7430LNEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶                              收藏

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相关产品

NEBNext® Ultra II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒
NEBNext® Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)
NEBNext® Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶(含纯化磁珠)

产品特点

·起始量范围广:50 ng 至 500 ng 的完整 DNA 均可制备高质量文库,且无需扩增步骤

·不同 DNA 起始量或 GC 含量的样本,都可使用同样的操作流程达到稳定可靠的片段化效果
·包含 NEBNext FS(片段化系统)酶法片段化试剂,使用同一种酶混合物即可完成 DNA 片段化、末端修复和加 dA 尾三个步骤
·更高的文库产量,获得更多有用信息
·提高文库均一性,进而提高测序质量
·不同类型的起始样本,均可制备 PCR-free 文库
·通过优化的 PCR-free 实验流程,减少手动操作时间,并可与自动化兼容
·配合使用 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)(NEB #E7395)或其它具有3 T 突出的适用于 Illumina 平台的接头
·也可提供含有样品纯化磁珠的 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-Free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)
 

产品概述

 没有偏差!基于简化可靠的 Ultra II FS 流程,适用于 Illumina® 测序平台的本试剂盒可为 DNA-seq 提供无需扩增的文库制备流程。即使 DNA 起始量低至 50 ng,也可获得高质量、高产量的文库,而无需担忧 PCR 偏差。

 
NEBNext Ultra II FS DNA PCR-Free 文库制备试剂盒包含不同起始量、完整的 DNA 文库制备所需的所有酶和缓冲液,以便在 Illumina 平台上进行二代测序,且不需要扩增步骤。快速、用户友好的流程包含可靠的酶法 DNA 片段化过程,仅需最少的手动操作时间,在无需 PCR 的情况下,就可获得优异的文库产量和 GC 覆盖度。
 
注意:如果您的起始 DNA 已被打断,我们推荐您使用 NEBNext® UltraII DNA PCR-free 文库制备试剂盒(NEB #E7410)。
 
产品描述: 
NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 - 含片段化酶            货   号                  #E7430L
图1:使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒,能获得更高的文库产量
 
A.以人 NA19240 基因组 DNA(Coriell Institute)为起始样本,使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒和 Illumina PCR-free 文库制备试剂盒分别制备 PCR-free 文库,350 bp 插入片段作为筛选标准。
B.分别使用基于酶法片段化的 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒和 Roche Sequencing Kapa HyperPlus 文库制备试剂盒,制备 150 – 200 bp 插入片段的 PCR-free 的文库,不进行片段筛选。根据生产商推荐方法,NEBNext 和 Kapa 试剂盒分别使用了 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)和 Kapa Dual-Indexed Adaptors。
NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 - 含片段化酶            货   号                  #E7430L
 
图2:使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒,实现人类基因组均一覆盖。相较于 Illumina DNA PCR-free 文库制备试剂盒,NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒可实现更高的基因组覆盖度。根据生产商推荐方法,以 250 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本,分别由 2 位实验员制备文库,使用 NovaSeq 6000 S4 v1.5 flow cell(PE 2 x 150 bp)测序。Reads 去接头(fastp 0.20.0)后比对至端粒到端粒 chm13 参考基因组(draft 1,bwa-mem 0.7.17),并标记重复(samblaster 0.1.24)。从每个 bam 中随机抽取 2.8 B Reads(sambamba view -s 0.6.8)。使用 mosdepth(v0.3.1,-F 772)评估过滤水平和初级覆盖度,并绘制常染色体或线粒体基因组图。图中标示出了预期覆盖度(num_reads*read length/genome size)。两位实验员在使用 Illumina PCR-free 文库制备试剂盒时覆盖度存在显著差异,而使用 FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒时不存在该问题,结果非常一致。
 

Human iPS Cell Generation™ All-in-One Vector酶试剂盒Takara


Human iPS Cell Generation All-in-One Vector
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Takara 3671 Human iPS Cell Generation All-in-One Vector 10 μg ¥10,014 Human iPS Cell Generation&trade; All-in-One Vector Human iPS Cell Generation&trade; All-in-One Vector Human iPS Cell Generation&trade; All-in-One Vector
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□ 浓度 0.5 μg/μl
     
□ 贮存溶液  
     Tris-HCl (pH 8.0) 10 mM
     EDTA 1 mM
Limited Use Label License: [L44], [M71]
 
■ 制品说明
本制品是制备Human iPS细胞诱导用逆转录病毒所使用的载体。在高效、高表达逆转录病毒载体pDON-5 DNA(Code No.: 3658)上,插入了iPS细胞诱导用基因OCT3/4SOX2KLF4LIN28NANOG,各基因以Thosea asigna virus 的2A*1序列连接在一个载体上。本载体与Retrovirus Packaging Kit Ampho(Code No.: 6161)中的pGP Vector以及pE-ampho Vector共转染至逆转录病毒制备用细胞G3T-hi(Code No.: 6163)后,可以制备iPS诱导用逆转录病毒。如此制备的重组逆转录病毒由于和RetroNectin®(Recombinant Human Fibronectin Fragment)(Code No.: T100A/B)有高亲和性,所以在向目的细胞中导入基因时,使用经RetroNectin®处理后的培养皿或平板,可以得到较高的基因导入率,有效提高iPS细胞的诱导效率。
*1 5种基因转录在同一个mRNA上,翻译时在2A序列的特定位点被分割,使5种蛋白质可以等量表达。
 
■ 保存
-20
 
■ 各载体的遗传信息
  基因名   GenBank Accession No.
  OCT4   NM_002701.4
  SOX2   NM_003106.2
  KLF4   NM_004235.3*2
  LIN28   NM_024674.4
  NANOG   NM_024865.2
*2 更新的NM_004235.4中,CDS的5’端追加了对应9个氨基酸的碱基。本制品的KLF4基因中不含N端的这9个氨基酸的序列,已经确认可以有效诱导iPS细胞。
 
■ 载体图谱
Human iPS Cell Generation&trade; All-in-One Vector
 
 
 
 

页面更新:2019-07-18 15:02:30

NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶(含纯化磁珠) 货 号 #E7435LNEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶(含纯化磁珠)                              收藏

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相关产品

NEBNext® Ultra II DNA PCR-Free 文库制备试剂盒

NEBNext® Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)
NEBNext® Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 – 含片段化酶

产品特点

·起始量范围广:50 ng 至 500 ng 的完整 DNA 均可制备高质量文库,且无需扩增步骤

·不同 DNA 起始量或 GC 含量的样本,都可使用同样的操作流程达到稳定可靠的片段化效果
·包含 NEBNext FS(片段化系统)酶法片段化试剂,使用同一种酶混合物即可完成 DNA 片段化、末端修复和加 dA 尾三个步骤
·更高的文库产量,获得更多有用信息
·提高文库均一性,进而提高测序质量
·不同类型的起始样本,均可制备 PCR-free 文库
·通过优化的 PCR-free 实验流程,减少手动操作时间,并可与自动化兼容
·配合使用 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)(NEB #E7395)或其它具有3T 突出的适用于 Illumina 平台的接头
·试剂盒提供 SPRIselect® 磁珠,可灵活方便地进行片段筛选和纯化
·也可提供不含样品纯化磁珠的 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-Free 文库制备试剂盒
 

产品概述

 没有偏差!基于简化可靠的 Ultra II FS 流程,适用于 Illumina® 测序平台的本试剂盒可为 DNA-seq 提供无需扩增的文库制备流程。即使 DNA 起始量低至 50 ng,也可获得高质量、高产量的文库,而无需担忧 PCR 偏差。

 
NEBNext Ultra II FS DNA PCR-Free 文库制备试剂盒包含不同起始量、完整的 DNA 文库制备所需的所有酶和缓冲液,以便在 Illumina 平台上进行二代测序,且不需要扩增步骤。快速、用户友好的流程包含可靠的酶法 DNA 片段化过程,仅需最少的手动操作时间,在无需 PCR 的情况下,就可获得优异的文库产量和 GC 覆盖度。
 
为方便起见,该试剂盒还提供 NEBNext 样品纯化磁珠(Beckman Coulter 的 SPRIselect 磁珠),可用于片段筛选和酶反应纯化步骤。
 
注意:如果您的起始 DNA 已被打断,我们推荐您使用 NEBNext® Ultra II DNA PCR-free 文库制备试剂盒(含纯化磁珠)(NEB #E7415)。
 
产品描述: 
NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 - 含片段化酶(含纯化磁珠)            货   号                  #E7435L
 
图1:使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒,能获得更高的文库产量。
A.以人 NA19240 基因组 DNA(Coriell Institute)为起始样本,使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒和 Illumina PCR-free 文库制备试剂盒分别制备 PCR-free 文库,350 bp 插入片段作为筛选标准。
B.分别使用基于酶法片段化的 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒和 Roche Sequencing Kapa HyperPlus 文库制备试剂盒,制备 150 – 200 bp 插入片段的 PCR-free 的文库,不进行片段筛选。根据生产商推荐方法,NEBNext 和 Kapa 试剂盒分别使用了 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 Index 引物,UMI 接头,适用于 DNA)和 Kapa Dual-Indexed Adaptors。
 
NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒 - 含片段化酶(含纯化磁珠)            货   号                  #E7435L
图2:使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒,实现人类基因组均一覆盖。相较于 Illumina DNA PCR-free 文库制备试剂盒,NEBNext Ultra II FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒可实现更高的基因组覆盖度。根据生产商推荐方法,以 250 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本,分别由 2 位实验员制备文库,使用 NovaSeq 6000 S4 v1.5 flow cell(PE 2 x 150 bp)测序。Reads 去接头(fastp 0.20.0)后比对至端粒到端粒 chm13 参考基因组(draft 1,bwa-mem 0.7.17),并标记重复(samblaster 0.1.24)。从每个 bam 中随机抽取 2.8 B Reads(sambamba view -s 0.6.8)。使用 mosdepth(v0.3.1,-F 772)评估过滤水平和初级覆盖度,并绘制常染色体或线粒体基因组图。图中标示出了预期覆盖度(num_reads*read length/genome size)。两位实验员在使用 Illumina PCR-free 文库制备试剂盒时覆盖度存在显著差异,而使用 FS DNA PCR-free 文库制备试剂盒时不存在该问题,结果非常一致。
 

Retrovirus Packaging Kit Eco酶试剂盒Takara


Retrovirus Packaging Kit Eco
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Takara 6160 Retrovirus Packaging Kit Eco 10 次 ¥2,003 Retrovirus Packaging Kit Eco Retrovirus Packaging Kit Eco Retrovirus Packaging Kit Eco
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■ 制品内容
pGP Vector (1 μg/μl) 50 μl
pE-eco Vector (1 μg/μl) 50 μl
Transfection Buffer
500 μl×10 支
2 M CaCl2
620 μl
25 mM Chloroquine
40 μl
本试剂盒中包含有2个病毒包装用质粒以及必要的转染用试剂。
 
■ 制品说明
本产品是逆转录病毒包装试剂盒,通过将插入有目的基因的逆转录病毒表达载体和2个特别设计的病毒包装用质粒通过磷酸钙法共转染到包装细胞中,可以得到高病毒滴度的逆转录病毒体。试剂盒中包含有表达gag-pol基因的质粒和表达ecotropic env基因的质粒。使用本产品包装得到的逆转录病毒可以用于感染大多数的小鼠和大鼠细胞。
试剂盒中特别设计的病毒包装用质粒上插入有逆转录病毒的结构基因,gag-polenv基因,这两种基因是逆转录病毒构建和复制所必需的基因,但是质粒上缺少包装信号Ψ序列和LTR序列,因此包装用质粒本身是无法包装成逆转录病毒的,只有将其和包含Ψ序列和LTR序列的逆转录病毒表达载体共转染到293或者293T包装细胞中,才能包装得到逆转录病毒体。试剂盒中同时还包含基于磷酸钙转染方法的转染试剂,方便客户使用,一般转染后48小时就可以得到高病毒滴度的逆转录病毒。
试剂盒中包装用质粒已经纯化可以直接用于转染,同时质粒上除了gag-polenv基因外,不包含其他任 何逆转录病毒来源的DNA序列,所以产生具有自我复制能力逆转录病毒的几率非常低。
本试剂盒与Takara Bio出售的所有逆转录病毒载体兼容,包括MMLV和MSCV的逆转录病毒。
 
Retrovirus Packaging Kit Eco
 
■ 保存
-20℃。
Transfection Buffer、2 M CaCl2、25 mM Chloroquine融化后4℃保存。
 
 

页面更新:2021-04-22 15:30:16

Retrovirus Packaging Kit Ampho酶试剂盒Takara


Retrovirus Packaging Kit Ampho
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Takara 6161 Retrovirus Packaging Kit Ampho 10 次 ¥2,003 Retrovirus Packaging Kit Ampho Retrovirus Packaging Kit Ampho Retrovirus Packaging Kit Ampho
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■ 制品内容
pGP Vector (1 μg/μl) 50 μl
pE-ampho Vector (1 μg/μl) 50 μl
Transfection Buffer
500 μl×10 支
2 M CaCl2
620 μl
25 mM Chloroquine
40 μl
本试剂盒中包含有2个病毒包装用质粒以及必要的转染用试剂。
 
■ 制品说明
Retrovirus Packaging Kit Ampho是逆转录病毒包装试剂盒,通过将插入有目的基因的逆转录病毒表达载体和2个特别设计的病毒包装用质粒通过磷酸钙法共转染到包装细胞中,可以得到高病毒滴度的逆转录病毒体。试剂盒中包含有表达gag-pol基因的质粒,pGP 质粒和表达amphotropic env基因的质粒及pE-ampho 质粒作为包装载体。使用本产品包装得到的逆转录病毒可以用于感染大多数的哺乳动物细胞。
试剂盒中特别设计的病毒包装用质粒上插入有逆转录病毒的结构基因,gag-polenv基因,这两种基因是逆转录病毒构建和复制所必需的基因,但是质粒上缺少包装信号Ψ序列和LTR序列,因此包装用质粒本身是无法包装成逆转录病毒的,只有将其和包含Ψ序列和LTR序列的逆转录病毒表达载体共转染到HEK293或者HEK293T包装细胞中,才能包装得到逆转录病毒体。试剂盒中同时还包含基于磷酸钙转染方法的转染试剂,方便客户使用,一般转染后48小时就可以得到高病毒滴度的逆转录病毒。
试剂盒中包装用质粒已经纯化可以直接用于转染,同时质粒上除了gag-polenv基因外,不包含其他任 何逆转录病毒来源的DNA序列,所以产生具有自我复制能力逆转录病毒的几率非常低。
 
Retrovirus Packaging Kit Ampho
 
■ 保存
-20℃。
Transfection Buffer、2 M CaCl2、25 mM Chloroquine融化后4℃保存。
 
 

页面更新:2020-04-30 14:02:41