NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠) 货 号 #E6330LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/免疫测序

NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)                              收藏

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#E6330L
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69,119.00

#E6330S
24 次反应
20,159.00

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相关产品

NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)

产品特点

 • 通过对受体序列的深入分析,揭示复杂的免疫系统

对 B 细胞受体(BCR)和 T 细胞受体(TCR)进行富集和测序
制备 B 细胞和 T 细胞的全长免疫基因组库
使用唯一分子标签序列(UMI)准确定量转录本
使用用于生物信息流程(教程)的开源软件工具——pRESTO 分析数据
 

产品说明

概述:

免疫组库测序常常用来分析当下的和过去的免疫应答反应。最常应用领域包括:自身免疫性疾病的表征、肿瘤学、传染病中和抗体的发现、肿瘤浸润淋巴细胞以及用作研究残留病的工具。二代测序(NGS)平台在读长和通量方面的最新进展促进了免疫组库测序的发展。

 

NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)通过对 B 细胞和 T 细胞全长免疫组库分析,能获得体细胞的所有突变信息。该试剂盒提供引物模块,可用于分析完整的 VDJ 区域和 IgMIgDIgGIgAIgE 亚类,并分析 BCR 轻链、BCR 重链、TCRα 链和 TCRβ 链。该试剂盒还提供分子标签序列(UMI,将来源于同一个分子的 PCR 产物组成共有序列,以便提高测序准确性,消除 PCR 偏差。Galaxy 平台提供一个开源软件工具——pRESTO,用于在本地或云端开展超强生物信息分析。为了确保不熟悉 Galaxy 平台的用户能成功使用分析软件,pRESTO 提供教学教程。

 

 抗体和 TCR 结构的简化示意图:

 

 NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)            货   号                  #E6330L

 

 免疫组建库流程:

 

 NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)            货   号                  #E6330L

产品描述:

NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)            货   号                  #E6330L

使用唯一分子标签序列(UMI)实现克隆型的精准检测。在有或没有 UMI 情况下,比较小鼠 TCR 克隆型频率。根据有 UMI 的测序结果,对前 100 个高表达克隆型进行排序。在有或没有 UMI 情况下,重复建库,克隆型频率重叠绘制于图中。每个条形或圆点代表一个克隆,该克隆经过总读长分析或使用 UMI 过滤。使用 UMI 可对原始样本中的起始 RNA 分子进行绝对定量。当将克隆按照富集度从高到底进行排序,没有 UMI 的数据会导致 PCR 或测序扩增的偏差,从而误导样本中克隆型频率的分析。UMI 的使用通过对起始样本中 RNA 的绝对定量来校正偏差。使用 UMI 也可以在重复本之间实现更好的相关性,尤其是起始量较低时。各个文库向下抽样 500,000 reads

NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)            货   号                  #E6330L

使用 NEBNext 免疫测序试剂盒(小鼠),能够在同一管中制备小鼠 BCR TCR 文库。分别使用 10 ng100 ng 1,000 ng 小鼠脾脏总 RNATakara Bio #636605)制备小鼠 BCR+TCR 文库,每个起始量都做有平行实验。所有文库向下抽样 1,000,000 reads。使用 pRESTO 工具完成 reads 过滤、序列组装和基于 UMIs 组成共有序列。使用 MiGMAP 鉴别 VD J 区域。图(A)表示每个小鼠脾脏总 RNA 起始样本检测到的克隆型数量。图(B)表示各文库中 B 细胞重链(IGH)和轻链(IGK IGL)以及 链(TRA)、β 链(TRB)、δ 链(TRD)和 γ 链(TRG)所占百分比。